Всё до банального просто...
Включается касса, и, если запустили АйлексНекст до печати стартового чека от Невы с параметрами ККТ, то будут указанные ошибки, и айлекс не "достучится" до КЯ Невы.
А вот если мы включим кассу, и запустим Айлекс после того, как Нева распечатает свой чек, то Айлекс прекрасно будет работать.
Делаю вывод, что КЯ не запускается до печати чека. Чек - как раз сигнал того, что КЯ запустилось успешно. А Айлекс, видимо, где-то в себе фиксирует отсутствие КЯ и больше не ищет/опрашивает его снова.
Клиенту сообщили, что следует дожидаться чека, и только потом запускать Айлекс