В ЛК ничего делать не надо. Делай только на кассе, перерегистрация и чек можно и не отправлять в ЛК... В ЛК же система налогообложения не выбирается...
Наверно так и есть , т.к. по другому не выходит. Был случай , только противоположный , в ЛК в заявлении не поставил галочку торг.подакцизными товар., сделал перерегистрацию в ЛК без замены ФН , пришла новая КР, в кассе ничего не делал.