Почти все сертификаты записываются криптопровайдером КриптоПро (ЕГАИС в их числе), есть сертификаты которые выпускают под VipNET, но их меньше, у меня такие просят выпускать образовательные учреждения.
Есть различие в обычных сертификатах для налоговой (офд, отчетности, различных гос. порталов) и сертификатом для ЕГАИС.
Тип сертификата выбирается на стадии создании заявки в удостоверяющий центр.
На Рутокен 2.0 можно записать и обычный сертификат, но работать с ЕГАИС он не будет.
И ещё, после записи ЕГАИС (так называемого ГОСТ) сертификата на Рутокен 2.0, нужно зайти на сайт
https://service.egais.ru/ и записать RSA сертификат, без которого УТМ не будет работать.
Еще один маленький нюанс с Эвоторами, на Рутокен 2.0 должно быть записано всего 2 действующих сертификата ГОСТ и RSA.
Когда сертификаты закончились, токен нужно форматнуть и только потом записывать новые.
Да и Эвототор за свой УТМ теперь просит 4500 деревянных в год за лайт версию
https://market.evotor.ru/store/apps/82efd65d-f552-4688-9bc3-5f5534437eea .