А что мешает создать один товар "Обувь" (если название товара в чеке не обязательно) и выбрать для него тип "Маркированная обувь" (или как он там называется)? При добавлении данного товара в чек эвотор просто запрашивает DM (при наличии приложения "Маркировка").
Собственно, в пятницу так и делал.